该片为2016年的《疯狂动物城》的续作，讲述了身为爬行动物的蛇盖瑞乱入动物城，造成了不小的混乱。为了搜集情报并抓住蛇盖瑞，朱迪和尼克不得不前往未曾去过的动物城偏远区域卧底，但在破案过程中，他们意识到此事另有隐情，于是在帮助蛇盖瑞逃跑后，一同沦为了“逃犯”。